Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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