Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms