Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPERQ9BY12 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms