Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms