Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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