Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 AC092123.2-201ENST00000611189 5421 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NDFIP1Q9BT67 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms