Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 VGLL1-201ENST00000370634 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 CRCT1-201ENST00000368790 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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