Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRIQ1Q96JM4 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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