Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 373.4 ms