Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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