Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPBP1Q92547 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms