Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRN4Q8WUT4 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms