Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms