Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms