Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms