Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms