Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms