Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMBR1LQ6UX01 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms