Protein–RNA interactions for Protein: Q5JST6

EFHC2, EF-hand domain-containing family member C2, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC2Q5JST6 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHC2Q5JST6 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms