Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms