Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYF9

KRTAP19-7, Keratin-associated protein 19-7, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP19-7Q3SYF9 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP19-7Q3SYF9 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms