Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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