Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms