Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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GEN1Q17RS7 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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GEN1Q17RS7 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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GEN1Q17RS7 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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GEN1Q17RS7 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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GEN1Q17RS7 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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GEN1Q17RS7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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