Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms