Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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SSX1Q16384 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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SSX1Q16384 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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SSX1Q16384 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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SSX1Q16384 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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SSX1Q16384 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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SSX1Q16384 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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