Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms