Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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PUM3Q15397 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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PUM3Q15397 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PUM3Q15397 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
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