Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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