Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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CDK5R1Q15078 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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