Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGEF6Q15052 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF6Q15052 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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