Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
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