Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms