Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A2Q12908 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms