Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms