Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFFO1Q0D2I5 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms