Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms