Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTBQ06643 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTBQ06643 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms