Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms