Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms