Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms