Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 KIF9-207ENST00000444589 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 TP53I11-203ENST00000395648 3381 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 PPP1R26P1-201ENST00000474415 3613 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX1P83916 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBX1P83916 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBX1P83916 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBX1P83916 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBX1P83916 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBX1P83916 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBX1P83916 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBX1P83916 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBX1P83916 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBX1P83916 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBX1P83916 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 EBF1-201ENST00000313708 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX1P83916 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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