Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 SLC14A1-205ENST00000502059 2371 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 AC109454.2-201ENST00000503470 520 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SUMO1P63165 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms