Protein–RNA interactions for Protein: P56704

WNT3A, Protein Wnt-3a, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT3AP56704 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
WNT3AP56704 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
WNT3AP56704 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
WNT3AP56704 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
WNT3AP56704 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
WNT3AP56704 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
WNT3AP56704 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms