Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD23BP54727 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms