Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA2D1P54289 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms