Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPOLAP51003 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPOLAP51003 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms