Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC11A1P49279 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms