Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AFMP43652 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AFMP43652 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AFMP43652 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms