Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP8P40818 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP8P40818 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP8P40818 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP8P40818 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP8P40818 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP8P40818 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP8P40818 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP8P40818 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP8P40818 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP8P40818 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP8P40818 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms